الأحد، 10 يونيو 2018

PCR

ما هو PCR  :

هو تقنية مخبريه تم اكتشافها عام 1983م  تقريباً تقوم على إكثار نسخ الحمض النووي (DNA )    خارج النظام الحيوي . أي أنها طريقة لنسخ الحمض النووي في المختبر. و لذلك فهي تقنية حيوية  لاستنساخ قطعة من محددة من الحمض النووي و  مضاعفة إنتاجها  لكي يتسنى إجرى عليه اختبارات و فحوصات إضافية.

  ما هي متطلباتPCR  :

لتقوم بإنتاج الحمض النووي (DNA )  بواسطة PCR يتتطلب عليك توفير :

1. جهاز   للتحكم بدرجات حرارة التفاعل بشمل دقيق و متتالي  ( الدورة الحرارية Thermocycle  ) : ويقوم هذا الجهاز بتغير درجة الحرارة بشكل سريع ، لآن تغير درجة الحرارة هو الأساس الذي تقوم عليه فكرة هذه التقنية .

2. البليمريز : وهو الإنزيم الذي يقوم ببناء وترتيب القواعد النيتروجينية  ( حدات الحمض النووي (DNA )  ) ، ويجب أن يكون هذا الإنزيم مقاوم للحرارة العالية ليتمكن من العمل . و قد اكتشف انزيم مقاوم للحرارة و اسم تاج Tag

3. مجموعة متفرقة من القواعد النيتروجينية: ( A T C G ) ليتمكن الإنزيم من ترتيبها في مواقعها أثناء عملية نسخ الحمض النووي (DNA )  .

4.      بريمر Primer  : وهو قطعة صغيرة من الحمض النووي (DNA )  ليتمكن الإنزيم من  بداء البناء  و النسخ  عليها .

5.       والشيء الأهم هو وجود نسخة من الحمض النووي (DNA )  المراد نسخه .

6.      بالإضافة إلى محلول أو وسط ليتم به التفاعل : وهذا المحلول يختلف بين تفاعل و أخر .

عملية النسخ :

بعد وضع الحمض النووي المراد نسخة  مع البريمر و  و إنزيم  البوليمريز و  مجموعة مع الأحماض النووية في أنبوب داخل جهاز  التحكم الحراري فان هناك 3 مراحل منفصلة  تمر بها عملية النسخ:

1. مرحلة التفكيك Denature   : رفع الحرارة إلى 94 ْم وذلك لفك الحمض النووي (DNA )  الأصل .

2. مرحلة الالتصاق   anneal  :  إنزال الحرارة إلى ما بين 55-60 ْم ليقوم البريمر بالألتزاق فيزيائياً بواسطة الروابط الهيدروجينية مع الحمض النووي (DNA )  الأصل .

3.      مرحلة الامتداد  extend   : ثم يقوم برفع درجة الحرارة إلى 75 ْم ليقوم البلمريز بعمله في بناء الحمض النووي (DNA )  الجديد .

وهذه المراحل الثلاث تعتبر دورة كاملة وفيها يصبح الحمض النووي (DNA ) الأصل قد تضاعف ، وتعتمد كمية ناتج الحمض النووي (DNA )  على عدد الدورات

تطبيقات PCR :

لتقنية PCR تطبيقات كثيرة في مجال أبحاث الحمض النووي (DNA )  و الوراثة ومنها :

1. الكشف عن الطفرات الوراثية : وذلك عن طريق وضع بريمر خاص للطفرة لتكثير الجين الخاص بها . ومنه نقوم بمعرفة المرض إذا كان على زوجين الكروموسومات أو على احدهما ( allele ) .

2.      تعين البصمة الوراثية .

3.      الكشف عن الفيروسات : وهذه الطريق هي الأدق في تحديد نوع وجنس الفيروس وكميته.

4. هو العنصر الأهم في عملية التجميع الجيني ( Recombinant الحمض النووي (DNA )   ) : حيث نقوم بتكثير الجين المراد إدخاله على البلازمد أو الحمض النووي (DNA )   المضيف .

5.      استخدامه في تغير نهايات الجين لتصبح متوافقة مع إنزيمات القطع ( Restriction enzyme ) .

6. هو العملية الأساس في تحديد تتابع القواعد النيتروجينية في  الحمض النووي (DNA )  ( الحمض النووي (DNA )  Sequencer  ) .

7.      معرفة طول الحمض النووي (DNA )  .

8.      تقنية الحمض النووي (DNA )   المكمل ( cالحمض النووي (DNA )  ) .

9.      تحديد الجين المطلوب من خليط من الجينات .

10.   يستخدم في تقنية (microarrays  ).

11.  في مشروع الخارطة الجينية البشرية (human genome project  ) .

12.  الساوثرين بلوت (southern plot  ) .

13.  تقنية ارتباط الحمض النووي (DNA )  – بروتين ( الحمض النووي (DNA ) -Protein Interaction ) .

14.  في مجال الطب الشرعي ( اختبار الأمومة ، حالات الاغتصاب ، تحديد الهوية ... الخ ) .

وغيرها من التطبيقات  المخبرية والبحثية .

أنواع PCR : هناك نوعان من PCR :

1.  PCR العادي : وهو ما تم شرحه والتطرق اليه في الخطوات السابقة .

2.  rtPCR : وهو اختصار لـ ( Real Time PCR ) : وهذا النوع يقوم على نفس المبدأ ولكن الخلاف الوحيد يكون مربتط الجهاز بكمبيوتر لتحديد الوقت الحقيقي لبدا التفاعل ومن ثم الكمية الحقيقية لعدد نسخ الحمض النووي (DNA )  ويعتمد ذلك على وجود قواعد نيتروجينية حرة مشعة لتحديد ذلك . مما يسهل على الباحثين الوقت لتحدد وجود الجين المطلوب أو لا ، وكمية الجين بدون الوصول إلى نهاية الدورات الحرارية المحددة .

ليست هناك تعليقات:

إرسال تعليق